Elméletileg sok hasznos dolgot lehet csinálni zöld hidrogénnel. Hozzáadhatja földgázhoz, és hő- vagy távfűtőművekben elégetheti. Használhatja más energiahordozók előanyagaként, az ammóniától a szintetikus szénhidrogénekig, vagy közvetlenül az autók és hajók üzemanyagcelláihoz. Először is egyszerűen helyettesítheti vele az ipari hidrogént, amelyet földgázból állítanak elő, csak az Egyesült Államokban évente körülbelül 10 millió tonnát.
A fő kérdés, hogy megfeleljünk ezeknek a potenciális piacoknak, az, hogyan juttassuk el a zöld hidrogént oda, ahol szükség van rá. A tűzveszélyes gáz tárolása és szállítása nem egyszerű; sok helyet foglal, és olyan tulajdonságokkal rendelkezik, amelyek az acélcsöveket és a hegesztett alkatrészeket törékennyé és meghibásodóvá teszik. Emiatt a nagy léptékű hidrogénszállításhoz dedikált csővezetékekre lesz szükség, amelyeket költséges lesz megépíteni a gáz nyomás alá helyezéséhez vagy folyadékká hűtéséhez. Az utolsó két folyamat energiaigényes, és tovább rontja az amúgy is szűkös zöld hidrogén oda-vissza hatásfokát.
